بزرگ ترین ویژگی آیفون ۵S مربوط به پردازنده آن، یعنی A7 این پردازنده بر اساس معماری ۶۴ بیت ساخته شده و به همین دلیل اولین پردازنده موبایل در جهان است که بر اساس این معماری کار می‌کند. استفاده از این پردازنده باعث خواهد شد تا توسه دهندگان اپلیکیشن، برنامه‌های خود را برای استفاده حداکثری از امکانات A7، مجددا از ابتدا بهینه نمایند. ویژگی دیگر این گوشی، سنسور تشخیص اثر انگشت است که در حال حاضر چندان کاربردی نیست و تنها می‌توان با استفاده از آن، قفل گوشی را باز نموده و یا از فروشگاه آیتونز خرید کرد. اپل ادعا می‌کند که اطلاعات مربوط به اثر انگشت کاربران در هیچ کدام از سرورهای اپل ذخیره نمی‌شوند و به همین دلیل جای نگرانی وجود ندارد.  

در مورد مشخصات و اندازه آیفون ۶ تاکنون گزارش‌های فراوان منتشر شده است.
اما گزارش جدید اعلام می‌دارد که این محصول در دو اندازه و با نمایشگرهای ۴.۷ و ۵.۵ اینچ عرضه می‌شوند و هیچ یک از این دو نمایشگر منحنی نیستند.

روزنامه وال‌استریت ژورنال نیز در تازه‌ترین گزارش خود نوشته است که شرکت اپل گوشی هوشمند آیفون ۶ را در دو اندازه بزرگ‌تر از ۴.۵ و ۵ اینچ مجهز به نمایشگر تخت و غیرمنحنی وارد بازار می‌کند.

بدنه این گوشی هوشمند از نوعی فلز موسوم به Liquidmetal ساخته شده است که نسبت به آلومینیوم به‌کار رفته در آیفون 5S سبک‌تر و مقاوم‌تر است.